侯建国（Hou Jianguo），男，汉族，化学家，中国科学院院士，第三世界科学院院士，中国科学技术大学校长，第十一届全国人大常委。
1959年生于福建，1978—1989年在中国科学技术大学学习，获凝聚态物理专业博士学位。1988年至1995年，先后在前苏联科学院结晶学研究所电镜实验室、中国科学院福建物质结构研究所、美国加州大学Berkeley分校、美国Oregon州立大学化学系从事科学研究工作。1995年起任中国科学技术大学教授，先后任中国科学院结构分析重点实验室主任、中国科学技术大学理化科学中心主任。2000年任中国科学技术大学副校长。2001年9月起任中国科学技术大学校友总会会长。2003年当选为中国科学院院士。2004年8月起兼任合肥微尺度物质科学国家实验室（筹）常务副主任。2004年11月当选为第三世界科学院院士。2005年9月任中国科学技术大学常务副校长。2008年9月任中国科学技术大学校长。
长期从事物理化学领域的研究工作，特别是在利用高分辨率扫描隧道显微镜研究单分子特征和操纵方面取得了一系列成果，为单分子物理化学领域的研究做出了理论和实验上的重要贡献。在Nature、Science、J. of Amer. Chem. Soc. 、Phys. Rev. lett. 等期刊杂志上发表学术论文100多篇，是该领域有国际影响的学者。
曾获国家杰出青年科学基金奖、中国科学院和安徽省自然科学一等奖、国家自然科学二等奖、香港求是基金会“杰出青年学者奖”、中国分析测试协会CAIA奖特等奖、海外华人物理学会“亚洲成就奖”、何梁何利科技进步奖、陈嘉庚化学科学奖等多项奖励，并荣获中科院有突出贡献的中青年专家、中科院优秀研究生导师和全国优秀留学回国人员等荣誉称号。
社会兼职：国际真空联盟执委，国际纯粹与应用化学联盟名誉委员，第七届中国科协委员，中国真空学会理事长，中国物理学会常务理事，中国材料研究学会理事，中国表面物理学会副主任委员；《纳米科学与技术》（American Scientific Pub.）、《国际纳米技术》（Inderscience Pub.）、《国际纳米科学》（World Scientific Pub.）以及《中国科学》、《中国化学物理》等杂志的编委和责任编辑；挪威Kavli奖纳米委员会成员，英国工程与自然科学研究委员会评委，中国实验室国家认可委员会成员，国家纳米科学中心学术委员会委员及纳米技术专门委员会副主任委员，教育部科学技术委员会委员以及一系列国际会议的程序委员会委员。